Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms