Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RITA1Q96K30 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms