Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAMP1Q96JM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms