Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HIC2Q96JB3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIC2Q96JB3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms