Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALSU1Q96EH3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALSU1Q96EH3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms