Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RMDN1Q96DB5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms