Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms