Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCC1Q96CN9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms