Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYTL4Q96C24 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYTL4Q96C24 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms