Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM52Q96A61 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM52Q96A61 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms