Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC47Q96A33 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC47Q96A33 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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