Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF34Q969K3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF34Q969K3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF34Q969K3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms