Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNPO1Q92973 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNPO1Q92973 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms