Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRPF31Q8WWY3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF31Q8WWY3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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