Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SEMA6DQ8NFY4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEMA6DQ8NFY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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