Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms