Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC83Q8IWF9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms