Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC84Q86UT8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms