Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDXQ7Z353 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDXQ7Z353 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms