Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms