Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTF1AQ7RTS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTF1AQ7RTS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms