Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q71RC1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q71RC1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q71RC1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q71RC1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q71RC1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q71RC1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms