Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms