Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf139Q6ZV77 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms