Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms