Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM72Q6ZMU5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms