Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms