Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC4A10Q6U841 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A10Q6U841 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms