Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUX4L9Q6RFH8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms