Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC27A4Q6P1M0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms