Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40BQ6NWY9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms