Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms