Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPPQ6IPU0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms