Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CREB3L3Q68CJ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms