Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHEQ5VZ18 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms