Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ECM29Q5VYK3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms