Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q5VSD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q5VSD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms