Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms