Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf66Q5T8R8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf66Q5T8R8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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