Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms