Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms