Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZBED5Q49AG3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZBED5Q49AG3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms