Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTLL9Q3SXZ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms