Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDRF1Q3B7T1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms