Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK2Q16620 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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