Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNAPC1Q16533 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNAPC1Q16533 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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