Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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