Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNGA3Q16281 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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