Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VAMP3Q15836 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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