Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC85BQ15834 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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